MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 plasmid pHCD

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017736	GAG	2	6	25	30	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017736	CTAA	2	8	35	42	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017736	A	6	6	1871	1876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017736	TTG	2	6	1933	1938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017736	A	6	6	1949	1954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017736	AAT	2	6	1961	1966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017736	A	7	7	1971	1977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017736	AT	3	6	2215	2220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017736	C	6	6	2254	2259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_017736	C	6	6	2264	2269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_017736	A	6	6	4656	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017736	A	6	6	4677	4682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017736	CA	3	6	4706	4711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017736	ATA	2	6	4742	4747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017736	ACT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017736	ACT	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017736	ACT	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017736	A	6	6	4936	4941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017736	CAA	2	6	4942	4947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017736	A	6	6	8019	8024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017736	TTG	2	6	8081	8086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017736	ACA	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017736	A	6	6	8367	8372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017736	TAA	2	6	8389	8394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017736	T	6	6	8399	8404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017736	G	8	8	8424	8431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017736	A	6	6	8442	8447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017736	T	6	6	8451	8456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017736	G	7	7	8458	8464	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017736	A	6	6	8475	8480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017736	T	6	6	8484	8489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017736	A	6	6	8496	8501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017736	T	6	6	8505	8510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017736	A	6	6	8604	8609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017736	TAA	2	6	8626	8631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017736	T	6	6	8636	8641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017736	G	8	8	8661	8668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017736	A	6	6	8679	8684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017736	T	6	6	8688	8693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017736	G	7	7	8695	8701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017736	A	6	6	8712	8717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017736	T	6	6	8721	8726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017736	A	6	6	8733	8738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017736	T	6	6	8742	8747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017736	A	6	6	8841	8846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017736	TAA	2	6	8863	8868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017736	T	6	6	8873	8878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017736	CTG	2	6	8890	8895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017736	CTAA	2	8	8950	8957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017736	AGG	2	6	8991	8996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017736	TTA	2	6	9057	9062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017736	ATCAT	2	10	9116	9125	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017736	TTA	2	6	12070	12075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017736	A	6	6	12203	12208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017736	A	7	7	12225	12231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.